医療費控除の計算の仕方を説明します。医療費控除として控除を受けられる金額は、次の計算式となります。支払った医療費－保険金等での補填金額－（合計所得金額×5％または10万円のいずれか低い額）＝医療費控除額。例えば、インプラント治療に支払った医療費210万円、保険金等での補填金0万円、当人の所得金額500万円と仮定しましょう。500万円×5％＝25万円となり、25万円は10万円より高くなりますから、210万円－10万円＝200万円、限度額の200万円以下ですので、200万円が医療費控除額となります。
受けた治療が医療費控除の対象かどうかの個別の判断につきましては、最寄の税務署で相談するか、または国税局のホームページを参照してください。インプラント治療での医療費控除の際には、所得税の納税額を確認しておきましょう。医療費控除は、すでに支払った所得税から返金される仕組みになっています。ですから、いくら医療費控除の対象額が条件を満たしていましても、所得税を支払っていない場合は、そもそも返還されるお金がありませんから、還付金はゼロとなります。
年収600万円の人が60万円のインプラントの治療費(医療費)を支払った場合です。医療費控除の対象額（A）＝インプラントの治療費60万円－10万円＝50万円。所得税からの控除額＝医療費控除の対象額（A）50万円ｘ20％＝10万円（B）。住民税からの控除額＝医療費控除の対象額（A）50万円ｘ10％＝5万円（C）。以上のようになりますから、所得税からの控除額10万円＋住民税からの控除額5万円＝15万円が返還される計算となります。
すなわち、インプラントの治療費60万円のうち15万円が戻ってきますから、60万円－15万円＝45万円が実際のインプラントの治療費ということになります。インプラントの治療費が高額なのは、まず健康保険が適用されないために保険外診療・自費・自由診療になるということが挙げられます。また、インプラント治療は、言い換えますと人工歯根の移植手術になります。つまり、簡単な手術ではないということです。